食品工业废水主要来自于食品加工中原辅材料、添加物及包装材料的加工处理等，加工过程中会产生废水，其含有乳化物、有机物、氨氮和色素等，根据环保要求，必须经过处理达标才能排放。因此在生产过程中所产生的废水需要经过一系列处理才能保证不破坏自然环境。大多数的食品工业污染主要是食品添加剂污染和食材自身污染，在食品加工中这两种污染都是常见的。食品工业废水具有污染严重、排放量大、水资源利用率低，食品废水重又含有大量可降解有机物质，如果直接从工厂排出，将对周围的水环境造成严重污染。食品废水的防污处理应在排放前完成。
那么食品工业废水如何处理呢？一般废水处理是通过一定的设备设施，结合屋里、生化技术去除水中的有害污染物质，使之达到可排放标准。不同的污水水质、水量、是否回用以及接纳水体等等都决定了废水处理方法。针对食品企业不同的生产经营状况以及污水水质可以采用不同的处理措施，目前常用的方法有物理处理法、好氧生物处理法、厌氧生物处理法等。
1、 生物处理法；物理处理法有筛滤、撇除、调节、沉淀、气浮、过滤、微滤、离心分离等，前五种工艺主要用于预处理或一级处理，后三种工艺主要用于深度处理；
2、 化学处理法；化学处理法有中和法、混凝法、电解法、氧化还原法、离子交换法、膜分离法等；
3、 生物处理法；生物处理工艺包括好氧生物处理工艺、厌氧生物处理工艺、稳定塘工艺、土地处理工艺和由上述工艺相结合而成的综合生物处理工艺。而根据食品工业废水BOD、COD值高等特点,国内外广泛采用的方法是生物处理法。