1、仔细认真核实验收材料
阅查《可行性研究报告》、《环境影响评价报告书》（表、登记表）、专家评估意见、环境影响评价文件批复、竣工验收监测报告，注意核实《可行性研究报告》、《环境影响评价报告书》及竣工验收监测报告的主要生产设施图示、生产工艺及污染防治设施是否对应，是否发生明显变化，发生变化的需仔细核实。
2、进厂核实实际生产工艺
《可行性研究报告》、《环境影响评价报告书》及竣工验收监测报告上的主要生产设备、生产工艺、污染防治设施基本符合要求后，应进厂核实以上情况，确保资料与实际生产一致。
3、对实际工况的核实
验收规定，在验收期间，生产工况应达到设计能力的75%，对于在验收期间，不符合上述规定的，验收监测报告提供的监测结果无效，不予以进行验收。
4、对污染治理设施的核实
在对相应的资料和工况进行核实后，重点进行污染防治设施建设情况及运行情况的核实，在核实过程中，应该注意污染防治设施的设计单位、施工单位的资质，对于无设计资质、施工资质单位建设的各项污染防治措施，严格上不是符合要求的或是无资质设计单位、施工单位设计的或是建设的污染防治设施是无效的。包括废水、废气、噪声、固体废物等污染防治设施，核实是否按可行性研报告、环境影响评价文件、环评批复的要求进行。是否能够达到相应的要求。
5、适当的结论
现场核实后，比较规范的企业，符合环境影响评价报告书（表、登记表）和环评批复要求的，可以进行适当的肯定，对于现场平面管理混乱，污染防治设施未按照环境影响评价报告书（表、登记表）和环评批复要求应该现场提出整改意见，并做出现场监察记录，责令企业进行现场改正。
建设项目环境保护设施竣工验收是以专家意见为参考，环境监察、污染控制等具体业务科室为主的综合决策过程。